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Text File  |  1995-03-04  |  1.7 KB  |  37 lines
  1. ***************************************************************
  2. * FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase signatures *
  3. ***************************************************************
  4.  
  5. FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase (EC 1.1.99.5) (GPD) catalyzes
  6. the conversion  of  glycerol-3-phosphate  into  dihydroxyacetone phosphate. In
  7. bacteria [1]  it  is  associated  with  the utilization of glycerol coupled to
  8. respiration. In  Escherichia  coli two isozymes are known: one expressed under
  9. anaerobic conditions (gene glpA) and one in aerobic conditions (gene glpD). In
  10. eukaryotes it  is  a  mitochondrial  enzyme which participates in the glycerol
  11. phosphate shuttle in conjunction with a NAD-dependent cytoplasmic GPD [2,3].
  12.  
  13. The enzymes  are  proteins  of  about  60  to 70 Kd which contain, in their N-
  14. terminal extremity, a probable FAD-binding domain.  We developed two signature
  15. patterns, one based on the first half of the FAD-binding  domain and one which
  16. corresponds to a conserved region in the central part of these enzymes.
  17.  
  18. -Consensus pattern: I-G-G-G-x(2)-G-[ATC]-G-x-A-x-D-x(3)-R-G
  19. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  20. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  21.  
  22. -Consensus pattern: G-G-K-x(2)-[GST]-Y-R-x(2)-A
  23. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  24. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  25.  
  26. -Expert(s) to contact by email: Brown L.J.
  27.                                 ljbrown2@facstaff.wisc.edu
  28.  
  29. -Last update: June 1994 / First entry.
  30.  
  31. [ 1] Austin D., Larson T.J.
  32.      J. Bacteriol. 173:101-107(1991).
  33. [ 2] Roennow B., Kielland-Brandt M.C.
  34.      Yeast 9:1121-1130(1993).
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  36.      J. Biol. Chem. 269:14363-14366(1994).
  37.